Forschungsprojekte

Aktuelle Forschungsprojekte

Wirt-Mikrobiom Interaktion: Implikationen für den zellulären und globalen Energiestoffwechsel in der Milchkuh (WiMiQ)

WiMiQ

Laufzeit: 2024-2026

Zusammen mit FLI Braunschweig (Dr J. Frahm, Prof. S. Dänicke), Uni Bonn (Prof. H. Sauerwein)

Publikationen

aus Vorläuferprojekt MitoCow:

Tröscher-Mußotter J, Saenz JS, Grindler S, Meyer J, Kononov SU, Mezger B, Borda-Molina D, Frahm J, Dänicke S, Camarinha-Silva A, Huber K, Seifert J (2021) Microbiome clusters disclose physiologic variances in dairy cows challenged by calving and lipopolysaccharides.

mSystems 6(5):e00856; doi.org/10.1128/mSystems.00856-21

Tröscher-Mußotter J, Deusch S, Borda-Molina D, Frahm J, Dänicke S, Camarinha-Silva A, Huber K, Seifert J (2022) Cow’s microbiome from antepartum to postpartum: A long-term study covering two physiological challenges.

Frontiers in Microbiology 13. doi: 10.3389/fmicb.2022.1000750

Mikrobielle und Wirts-spezifische Nutzung von myo-Inositol im Verdauungstrakt der Legehenne

Mikrobielle und Wirts-spezifische Nutzung von myo-Inositol im Verdauungstrakt der Legehenne

Teilprojekt DFG Forschergruppe ‘Appearance and physiological relevance of inositol phosphates and myo-inositol in the domesticated fowl’ FOR 2601

Projektbeginn: 2022
Projektende: 2025

Beteiligte Personen
Beteiligte Einrichtungen

PiFerm - Erbsen in der Fütterung von Schweinen: Einfluss von fermentierbaren Kohlenhydraten, bakterieller Fermentation und Enzymzusätzen auf Nährstoffverdaulichkeit und Mikrobiota

2023-2026
Förderung durch Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung

Beteiligte Einrichtungen

Dies ist ein Kooperationsprojekt mit den Arbeitsgruppen von Prof. Amélia Camarinha-Silva und Prof. Markus Rodehutscord

Einfluss von mikrobiell gebildeter Indol-3-Propionsäure auf den Wirtsmetabolismus und seine Gesundheit

Einfluss von mikrobiell gebildeter Indol-3-Propionsäure auf den Wirtsmetabolismus und seine Gesundheit

Partnerschaftsprogramm der Hebrew University of Jerusalem – University of Hohenheim

2024-2025

Dr. Kfir Sharabi (Institute of Biochemistry, Food Science and Nutrition, The Robert H. Smith Faculty of Agriculture, Food and Environment, The Hebrew University of Jerusalem)

Interplay between fermentative and respiratory energy conservation in Prevotella sp.

Laufzeit: 2017-2022
Förderkennzeichen: DFG (SE 2059/3-1)

Beteiligte Personen
Publikationen

Deusch S, Bok E, Schleicher L, Seifert J, Steuber J (2019) Occurrence and function of the Na+-translocating NADH:Quinone oxidoreductase in Prevotella spp. Microorganisms 7(5), 117, doi: 10.3390/microorganisms7050117

Schleicher L, Fritz G, Seifert J, Steuber J (2020) Anoxic cell rupture of Prevotella bryantii by high-pressure homogenization protects the Na+-translocating NADH:quinone oxidoreductase from oxidative damage. Archive of Microbiology 202, 1263–1266, doi: 10.1007/s00203-019-01805-x

Trautmann A, Schleicher L, Deusch S, Gätgens J, Steuber J, Seifert J (2020) Short-chain fatty acids modulate metabolic pathways and membrane lipids in Prevotella bryantii B14. Proteomes. 8, 28; doi:10.3390/proteomes8040028

Schleicher L, Trautmann A, Stegmann D, Fritz G, Gätgens J, Bott M, Hein S, Simon J, Seifert J, Steuber J (2021) A sodium-translocating module linking succinate production to formation of a membrane potential in Prevotella bryantii. Applied and Environmental Microbiology. doi.10.1128/AEM.01211-21.

Trautmann A, Schleicher L, Pfirrmann J, Boldt C, Steuber J, Seifert J (2021) Na+-coupled respiration and reshaping of extracellular polysaccharide layer counteract monensin-induced cation permeability in Prevotella bryantii B14. International Journal of Molecular Sciences 22: 10202; doi.10.3390/ijms221910202.

Trautmann A, Schleicher L, Koch A, Günther J, Steuber J, Seifert J. (2022) A shift towards succinate-producing Prevotella in the ruminal microbiome challenged with monensin. Proteomics. e2200121. doi: 10.1002/pmic.202200121

Hau JL, Schleicher L, Herdan S, Simon J, Seifert J, Fritz G, Steuber J (2023) Functionality of the Na+-translocating NADH:quinone oxidoreductase and quinol:fumarate reductase from Prevotella bryantii inferred from homology modeling. Archives in Microbiology. 206(1):32. doi: 10.1007/s00203-023-03769-5.

Verbesserung der Proteinnutzungeffizienz beim Schwein

Projektbeginn: 01.08.2019
Projektende:
Förderung: Wilhelm Schaumann Stiftung

Das übergeordnete Ziel dieses Projekts ist es, den Einfluss von Mikrobiom, Tiergenetik, Ernährung und Proteinmetabolismus auf die Effizienz der Proteinverwertung zu identifizieren.

Das Fachgebiet ‚Funktionelle Mikrobiologie bei Nutztieren' untersucht das Proteom entlang des Verdauungstraktes der Schweine und die Aktivität proteolytischer Enzyme. 

Beteiligte Personen
Beteiligte Einrichtungen

Dies ist ein Kooperationsprojekt mit den Arbeitsgruppen von Prof. Amélia Camarinha-Silva, Prof. Markus Rodehutscord und Prof. Jörn Bennewitz.

Publikationen

Kurz A, Seifert J (2021) Factors Influencing Proteolysis and Protein Utilization in the Intestine of Pigs: A Review.

Animals 11(12):3551; doi.org/10.3390/ani11123551

Sarpong N, Seifert J, Bennewitz J, Rodehutscord M, Camarinha-Silva A (2024) Microbial signatures and enterotype clusters in fattening pigs: implications for nitrogen utilization efficiency.

Frontiers in Microbiology.15. doi: 10.3389/fmicb.2024.1354537

Schmid M, Weishaar R, Seifert J, Camarinha-Silva A, Rodehutscord M, Bennewitz J (2024) Genomic analyses of nitrogen utilization efficiency, its indicator trait blood urea nitrogen and the relationship to classical growth performance and feed efficiency traits in a Landrace x Piétrain crossbred population.

Journal of Animal Breeding and Genetics. doi: 10.1111/jbg.12864

 

Abgeschlossene Forschungsprojekte

MitoCow: Mitochondrial functionality in dairy cows

01.07.2017 - 2022

People
Groups
Publications

Tröscher-Mußotter J, Saenz JS, Grindler S, Meyer J, Kononov SU, Mezger B, Borda-Molina D, Frahm J, Dänicke S, Camarinha-Silva A, Huber K, Seifert J (2021) Microbiome clusters disclose physiologic variances in dairy cows challenged by calving and lipopolysaccharides.

mSystems 6(5):e00856; doi.org/10.1128/mSystems.00856-21

 

Tröscher-Mußotter J, Deusch S, Borda-Molina D, Frahm J, Dänicke S, Camarinha-Silva A, Huber K, Seifert J (2022) Cow’s microbiome from antepartum to postpartum: A long-term study covering two physiological challenges.

Frontiers in Microbiology 13. doi: 10.3389/fmicb.2022.1000750

Influence of microbiome and associated metabolites on epithelial function and smooth muscle contractility with respect to InsP6 degradation

Project within DFG Research Unit ‘Appearance and physiological relevance of inositol phosphates and myo-inositol in the domesticated fowl’ FOR 2601

Projektbeginn: 01.05.2018
Projektende: 31.12.2021

People

 

Publications

Röhm K, Gonzalez-Uarquin F, Harmel RK, Trung MN, Diener M, Fiedler D, Huber K, Seifert J. (2021) Investigation of a potential electrogenic transport-system for myo-inositol in the small intestine of laying hens.    British Poultry Science; doi.org/10.1080/00071668.2021.1958301

 

Röhm K, Diener M, Huber K, Seifert J. (2021) Characterization of the cecal smooth muscle contraction in laying hens. Veterinary Sciences 8(6), 91; doi.org/10.3390/vetsci8060091

 

 

 

 

Microbiota-based SCReening of Anal Cancer in HIV-infected individuals (SCRAtCH), Era-Net Transcan

Project time: 2019-2022
Funding: EU, BMBF

Researchers
Groups

Publications

Serrano-Villar S, Tincati C, Raju SC, Sáenz JS, Moreno E, Bargiela R, Cabello A, Sendagorta E, Kurz A, Perez Molina JA, de Benito A, Hov JR, Fernandez-Lopez L, Muriel A, del Campo R, Moreno S, Trøseid M, Seifert J, Ferrer M. (2023) Microbiome-derived cobalamin and succinyl-CoA as biomarkers for improved screening of anal cancer.

Nature Medicine. 29. 1738-1749. doi:10.1038/s41591-023-02407-3

 

 

Comprehensive characterization of the microbiota associated with InsP6 degradation in the gastrointestinal tract of laying hens and quails

Comprehensive characterization of the microbiota associated with InsP6 degradation in the gastrointestinal tract of laying hens and quails

Teilprojekt DFG Forschergruppe ‘Appearance and physiological relevance of inositol phosphates and myo-inositol in the domesticated fowl’ FOR 2601

Projektbeginn: 01.01.2018
Projektende: 2022

Beteiligte Personen
Beteiligte Einrichtungen
Publikationen

Roth C, Sims T, Rodehutscord M, Seifert J, Camarinha-Silva A. (2022) The active core microbiota of two high-yielding laying hen breeds fed with different levels of calcium and phosphorus.

Frontiers in Physiology 13. doi:10.3389/fphys.2022.951350.

Entstehung von Inositolphosphaten im Verdauungstrakt und Wirkung auf die intestinale Mikrobiota, Phosphorverwertung und Tiergesundheit (microP+)

Universität Hohenheim, 2014 - 2017

Metaproteomische Analysen der Mikrobiota in monogastrischen Tieren (Broiler, Schwein) bei unterschiedlicher Phosphatverfügbarkeit im Futter (METAPHOR)

Baden-Württemberg, MWFK, Junior-Professuren Programm, 2014 – 2017