Forschungsprojekte
EMMA2 - Effizienzanalyse anhand von Mikrobiom- und Metabolomdaten und Modellierung von Akquisition und Allokation bei Milchkühen
Effizienzanalyse anhand von Mikrobiom- und Metabolomdaten und Modellierung von Akquisition und Allokation bei Milchkühen - EMMA2
Laufzeit: 2026-2030
Förderung durch Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung
- Eva Hoffmann
- Prof. Jana Seifert
- Prof. Jörn Bennewitz
Dies ist ein Kooperationsprojekt mit
- Georg-August-Universität Göttingen
- Christian-Albrechts-Universität zu Kiel (CAU)
- Vereinigte Informationssysteme Tierhaltung w.V. (vit)
Metabolic labeling of complex microbial communities (MSCA-DN METAMIC3)
Laufzeit: seit 01.10.2025
Förderkennzeichen: HORIZON TMA MSCA Doctoral Networks
METAMIC3 - Metaproteome-based leveraged microbiome management in the context of One Health
Beteiligte Personen
- Prof. Dr. Jana Seifert
- M.Sc. Ashraful Abid
This project aims to applying protein-labeling techniques such as protein-stable isotope probing (SIP) and click chemistry approaches such as bioorthogonal non-canonical amino acid tagging (BONCAT) for an enhanced identification of metabolic active microbes (WP3). We will apply these techniques to reconstruct metabolic networks in microbial communities originating from various environmental and organismal samples, identify the cellular response of single species, or simplify MOCK communities relevant to specific objectives described in WP1. This will reveal the influence of antimicrobial effectors in different microbiomes. In addition, the replication of phages triggered by microbe-phage interactions or environmental stress will be confirmed by BONCAT (in collaboration with AUAS).
Wie Segatella copri mit Sauerstoff umgeht: Mechanismen für die Umwandlung von O2 und Peroxiden in einem obligat anaeroben Darmbakterium
Laufzeit: since 01.01.2026
Förderung: DFG SPP 2474 Illuminating gene functions in the human gut microbiome
Beteiligte Personen
Methabreed - Reduktion der Methanemission bei Milchkühen
Nachhaltige Reduktion von Methanemissionen in Milchkuhbetrieben mittels züchterischer Strategien bei gleichzeitiger Verbesserung der Futtereffizienz und Tiergesundheit (MethaBreed) - Teilprojekt 4
Laufzeit: 2025-2027
Förderung durch Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung
Dies ist ein Kooperationsprojekt mit
- Förderverein Bioökonomieforschung e.V. (FBF)
- Vereinigte Informationssysteme Tierhaltung w.V. (vit)
- Justus-Liebig-Universität Gießen (JLU)
- Christian-Albrechts-Universität zu Kiel (CAU)
Zusammenhang zwischen Metall-Homöostase und Katabolismus von Prevotellaceae im Pansen
Laufzeit: seit 01.01.2025
Förderkennzeichen: DFG (327953272)
Beteiligte Personen
Publikationen aus dem Vorläuferprojekt:
Deusch S, Bok E, Schleicher L, Seifert J, Steuber J (2019) Occurrence and function of the Na+-translocating NADH:Quinone oxidoreductase in Prevotella spp. Microorganisms 7(5), 117, doi: 10.3390/microorganisms7050117
Schleicher L, Fritz G, Seifert J, Steuber J (2020) Anoxic cell rupture of Prevotella bryantii by high-pressure homogenization protects the Na+-translocating NADH:quinone oxidoreductase from oxidative damage. Archive of Microbiology 202, 1263–1266, doi: 10.1007/s00203-019-01805-x
Trautmann A, Schleicher L, Deusch S, Gätgens J, Steuber J, Seifert J (2020) Short-chain fatty acids modulate metabolic pathways and membrane lipids in Prevotella bryantii B14. Proteomes. 8, 28; doi:10.3390/proteomes8040028
Schleicher L, Trautmann A, Stegmann D, Fritz G, Gätgens J, Bott M, Hein S, Simon J, Seifert J, Steuber J (2021) A sodium-translocating module linking succinate production to formation of a membrane potential in Prevotella bryantii. Applied and Environmental Microbiology. doi.10.1128/AEM.01211-21.
Trautmann A, Schleicher L, Pfirrmann J, Boldt C, Steuber J, Seifert J (2021) Na+-coupled respiration and reshaping of extracellular polysaccharide layer counteract monensin-induced cation permeability in Prevotella bryantii B14. International Journal of Molecular Sciences 22: 10202; doi.10.3390/ijms221910202.
Trautmann A, Schleicher L, Koch A, Günther J, Steuber J, Seifert J. (2022) A shift towards succinate-producing Prevotella in the ruminal microbiome challenged with monensin. Proteomics. e2200121. doi: 10.1002/pmic.202200121
Hau JL, Schleicher L, Herdan S, Simon J, Seifert J, Fritz G, Steuber J (2023) Functionality of the Na+-translocating NADH:quinone oxidoreductase and quinol:fumarate reductase from Prevotella bryantii inferred from homology modeling. Archives in Microbiology. 206(1):32. doi: 10.1007/s00203-023-03769-5.
WiMiQ
Laufzeit: 2024-2026
DFG: Projektnummer 202989534
Zusammen mit FLI Braunschweig (Dr J. Frahm, Prof. S. Dänicke), Uni Bonn (Prof. H. Sauerwein)
Publikationen
aus Vorläuferprojekt MitoCow:
Tröscher-Mußotter J, Saenz JS, Grindler S, Meyer J, Kononov SU, Mezger B, Borda-Molina D, Frahm J, Dänicke S, Camarinha-Silva A, Huber K, Seifert J (2021) Microbiome clusters disclose physiologic variances in dairy cows challenged by calving and lipopolysaccharides.
mSystems 6(5):e00856; doi.org/10.1128/mSystems.00856-21
Tröscher-Mußotter J, Deusch S, Borda-Molina D, Frahm J, Dänicke S, Camarinha-Silva A, Huber K, Seifert J (2022) Cow’s microbiome from antepartum to postpartum: A long-term study covering two physiological challenges.
Frontiers in Microbiology 13. doi: 10.3389/fmicb.2022.1000750
2023-2026
Förderung durch Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung
Beteiligte Einrichtungen
Dies ist ein Kooperationsprojekt mit den Arbeitsgruppen von Prof. Amélia Camarinha-Silva und Prof. Markus Rodehutscord
Publikationen
Quinger F, Klein N, Steinhoff-Wagner J, Camarinha-Silva A, Rodehutscord M, Seifert J (2026) Field pea variants affect nutrient digestibility and gut microbiome in pigs.
Journal of Animal Science. skag346. doi: 10.1093/jas/skag346
Quinger F, Klein N, Camarinha-Silva A, Seifert J, Rodehutscord M (2026) Evaluation of pea grains using coupled in vitro assays for precaecal digestion and hindgut fermentation in pigs.
Archives of Animal Nutrition. 1-15. doi: 10.1080/1745039X.2025.2606085